Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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