Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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