Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BcanQ61361 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BcanQ61361 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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