Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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