Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms