Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms