Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms