Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P10404 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P10404 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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