Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms