Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms