Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim68Q8K243 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim68Q8K243 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim68Q8K243 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim68Q8K243 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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