Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2q1Q7TSS2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms