Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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