Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cnih1O35372 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms