Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trim44Q9QXA7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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