Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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