Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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