Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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