Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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BNIP3Q12983 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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