Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfdp1O88271 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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