Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms