Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trpc2Q9R244 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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