Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms