Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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