Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC080037.1-201ENST00000584975 889 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007785.3-201ENST00000595955 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00595-210ENST00000634452 562 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R3C-201ENST00000261475 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PDHA2-201ENST00000295266 1456 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133464.1-205ENST00000634595 1535 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4S1-201ENST00000216366 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-46-201ENST00000390622 655 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1P66-201ENST00000416539 934 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00381-201ENST00000423629 727 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035252.1-201ENST00000440642 895 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB3-202ENST00000448012 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms