Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms