Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms