Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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