Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms