Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms