Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms