Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrc17Q9CXD9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms