Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LcorQ6ZPI3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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