Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab3ipQ68EF0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms