Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms