Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms