Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms