Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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