Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf9P54130 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms