Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms