Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms