Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ophn1Q99J31 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms