Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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