Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms