Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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