Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gnb1P62874 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gnb1P62874 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gnb1P62874 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gnb1P62874 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms