Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg6P61406 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg6P61406 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms