Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms