Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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