Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc22a4Q9Z306 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a4Q9Z306 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a4Q9Z306 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms